Fin dal tardo periodo Jōmon vaghi in pietre dure e semipreziose levigate e forate furono usati come amuleti protettivi contro gli spiriti maligni nei momenti di pericolo.  Durante il periodo Yayoi, il magatama assunse la caratteristica forma a virgola e, durante il successivo periodo Kofun le collane fatte di vaghi tubolari in diaspro (kutadama), costituivano ornamenti indicativi di condizioni sociali e religiose elevate. Di grande valore spirituale, il magatama è tuttora utilizzato come oggetto cerimoniale in ambito shintoista. I nostri reperti, databili al IV-VI secolo d.c., erano parte di corredi funerari principeschi del periodo Kofun.